Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HKR1P10072 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HKR1P10072 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HKR1P10072 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HKR1P10072 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HKR1P10072 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HKR1P10072 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HKR1P10072 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HKR1P10072 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HKR1P10072 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HKR1P10072 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms