Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIMD1P0DJR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIMD1P0DJR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms