Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM200BP0CF97 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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