Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00032P0C843 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00032P0C843 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms