Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP1P09874 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP1P09874 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP1P09874 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP1P09874 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP1P09874 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP1P09874 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP1P09874 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP1P09874 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP1P09874 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP1P09874 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP1P09874 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP1P09874 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP1P09874 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP1P09874 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP1P09874 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP1P09874 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP1P09874 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP1P09874 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP1P09874 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP1P09874 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP1P09874 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP1P09874 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP1P09874 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP1P09874 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP1P09874 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP1P09874 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP1P09874 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP1P09874 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP1P09874 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP1P09874 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP1P09874 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP1P09874 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP1P09874 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP1P09874 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP1P09874 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PARP1P09874 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP1P09874 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP1P09874 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP1P09874 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP1P09874 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP1P09874 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP1P09874 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms