Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTAP09496 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTAP09496 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTAP09496 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTAP09496 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTAP09496 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTAP09496 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTAP09496 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTAP09496 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTAP09496 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTAP09496 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTAP09496 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTAP09496 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTAP09496 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTAP09496 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTAP09496 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTAP09496 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTAP09496 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTAP09496 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTAP09496 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTAP09496 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTAP09496 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTAP09496 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTAP09496 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTAP09496 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTAP09496 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTAP09496 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLTAP09496 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLTAP09496 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTAP09496 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTAP09496 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTAP09496 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms