Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP1P09455 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP1P09455 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP1P09455 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP1P09455 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP1P09455 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP1P09455 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP1P09455 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP1P09455 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP1P09455 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP1P09455 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP1P09455 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP1P09455 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP1P09455 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP1P09455 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP1P09455 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP1P09455 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP1P09455 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP1P09455 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP1P09455 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms