Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN3P07498 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN3P07498 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN3P07498 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN3P07498 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN3P07498 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN3P07498 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN3P07498 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSN3P07498 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSN3P07498 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSN3P07498 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSN3P07498 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms