Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDHBP07195 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDHBP07195 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDHBP07195 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LDHBP07195 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LDHBP07195 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LDHBP07195 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LDHBP07195 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LDHBP07195 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDHBP07195 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LDHBP07195 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LDHBP07195 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LDHBP07195 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LDHBP07195 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHBP07195 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHBP07195 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHBP07195 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHBP07195 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHBP07195 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LDHBP07195 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHBP07195 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHBP07195 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHBP07195 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHBP07195 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHBP07195 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHBP07195 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHBP07195 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHBP07195 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHBP07195 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDHBP07195 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms