Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLBP06746 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLBP06746 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLBP06746 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLBP06746 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLBP06746 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLBP06746 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLBP06746 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLBP06746 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLBP06746 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLBP06746 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLBP06746 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLBP06746 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLBP06746 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLBP06746 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLBP06746 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLBP06746 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLBP06746 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLBP06746 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLBP06746 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLBP06746 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLBP06746 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLBP06746 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLBP06746 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLBP06746 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms