Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCCBP05166 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCCBP05166 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCCBP05166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCCBP05166 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCCBP05166 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCCBP05166 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCCBP05166 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCCBP05166 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCCBP05166 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCCBP05166 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCBP05166 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCBP05166 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCBP05166 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCBP05166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCBP05166 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCCBP05166 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCCBP05166 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms