Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOSP01100 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOSP01100 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOSP01100 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOSP01100 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSP01100 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSP01100 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSP01100 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOSP01100 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FOSP01100 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOSP01100 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOSP01100 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSP01100 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSP01100 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSP01100 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOSP01100 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOSP01100 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOSP01100 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOSP01100 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FOSP01100 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOSP01100 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOSP01100 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOSP01100 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOSP01100 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSP01100 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSP01100 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSP01100 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOSP01100 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOSP01100 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSP01100 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSP01100 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOSP01100 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOSP01100 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOSP01100 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms