Protein–RNA interactions for Protein: O95757

HSPA4L, Heat shock 70 kDa protein 4L, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4LO95757 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4LO95757 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA4LO95757 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA4LO95757 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA4LO95757 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA4LO95757 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA4LO95757 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA4LO95757 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms