Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF6O94906 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF6O94906 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms