Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPM1BO75688 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPM1BO75688 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms