Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC45O75419 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC45O75419 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC45O75419 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC45O75419 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC45O75419 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC45O75419 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC45O75419 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC45O75419 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC45O75419 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC45O75419 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC45O75419 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC45O75419 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC45O75419 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC45O75419 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC45O75419 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC45O75419 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC45O75419 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC45O75419 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC45O75419 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms