Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFYO75367 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFYO75367 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFYO75367 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms