Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP12O75317 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP12O75317 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP12O75317 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP12O75317 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP12O75317 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP12O75317 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP12O75317 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP12O75317 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP12O75317 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP12O75317 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP12O75317 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP12O75317 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP12O75317 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP12O75317 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP12O75317 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP12O75317 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP12O75317 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP12O75317 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP12O75317 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP12O75317 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP12O75317 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP12O75317 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP12O75317 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP12O75317 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP12O75317 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP12O75317 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP12O75317 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP12O75317 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms