Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM24O75264 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms