Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE3O75131 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE3O75131 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms