Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX2O60749 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX2O60749 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX2O60749 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX2O60749 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX2O60749 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX2O60749 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX2O60749 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX2O60749 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX2O60749 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX2O60749 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX2O60749 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX2O60749 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX2O60749 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX2O60749 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX2O60749 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX2O60749 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX2O60749 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX2O60749 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX2O60749 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX2O60749 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX2O60749 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX2O60749 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX2O60749 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX2O60749 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX2O60749 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX2O60749 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX2O60749 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX2O60749 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms