Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA3O60609 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA3O60609 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA3O60609 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms