Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLXNC1O60486 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PLXNC1O60486 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PLXNC1O60486 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms