Protein–RNA interactions for Protein: O60333

KIF1B, Kinesin-like protein KIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1BO60333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIF1BO60333 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIF1BO60333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KIF1BO60333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIF1BO60333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms