Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD5O60279 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms