Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH3O43739 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH3O43739 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH3O43739 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH3O43739 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH3O43739 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH3O43739 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH3O43739 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH3O43739 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH3O43739 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH3O43739 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH3O43739 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH3O43739 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYTH3O43739 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYTH3O43739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYTH3O43739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYTH3O43739 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CYTH3O43739 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYTH3O43739 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYTH3O43739 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms