Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK2O43353 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK2O43353 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK2O43353 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms