Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFS4O43181 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms