Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN3O15551 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms