Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01565O15544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01565O15544 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms