Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLOCKO15516 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms