Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUPL2O15504 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NUPL2O15504 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms