Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2DO15399 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2DO15399 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2DO15399 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2DO15399 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms