Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBX3O15119 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBX3O15119 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBX3O15119 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX3O15119 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX3O15119 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX3O15119 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX3O15119 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX3O15119 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX3O15119 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX3O15119 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX3O15119 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX3O15119 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX3O15119 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX3O15119 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX3O15119 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX3O15119 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX3O15119 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX3O15119 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX3O15119 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX3O15119 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX3O15119 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX3O15119 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX3O15119 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX3O15119 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX3O15119 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX3O15119 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX3O15119 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX3O15119 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX3O15119 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX3O15119 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX3O15119 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX3O15119 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX3O15119 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX3O15119 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX3O15119 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX3O15119 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX3O15119 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX3O15119 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX3O15119 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX3O15119 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX3O15119 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX3O15119 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX3O15119 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX3O15119 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX3O15119 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX3O15119 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX3O15119 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX3O15119 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX3O15119 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX3O15119 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms