Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1O15118 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1O15118 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1O15118 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1O15118 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1O15118 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1O15118 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPC1O15118 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPC1O15118 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1O15118 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1O15118 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1O15118 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1O15118 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1O15118 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1O15118 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1O15118 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1O15118 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1O15118 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1O15118 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1O15118 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1O15118 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1O15118 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1O15118 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1O15118 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPC1O15118 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1O15118 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1O15118 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1O15118 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1O15118 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1O15118 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1O15118 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1O15118 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1O15118 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1O15118 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1O15118 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1O15118 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1O15118 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1O15118 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms