Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHUKO15111 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHUKO15111 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHUKO15111 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHUKO15111 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHUKO15111 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHUKO15111 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHUKO15111 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHUKO15111 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHUKO15111 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHUKO15111 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHUKO15111 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHUKO15111 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHUKO15111 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHUKO15111 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHUKO15111 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHUKO15111 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHUKO15111 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHUKO15111 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHUKO15111 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHUKO15111 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHUKO15111 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms