Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNPHO15079 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNPHO15079 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNPHO15079 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNPHO15079 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNPHO15079 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNPHO15079 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNPHO15079 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNPHO15079 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNPHO15079 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNPHO15079 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNPHO15079 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNPHO15079 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNPHO15079 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNPHO15079 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNPHO15079 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNPHO15079 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNPHO15079 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNPHO15079 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNPHO15079 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNPHO15079 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNPHO15079 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNPHO15079 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNPHO15079 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNPHO15079 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNPHO15079 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms