Protein–RNA interactions for Protein: O14782

KIF3C, Kinesin-like protein KIF3C, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3CO14782 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF3CO14782 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3CO14782 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3CO14782 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIF3CO14782 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF3CO14782 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms