Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS6O14544 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms