Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BIN1O00499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BIN1O00499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BIN1O00499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BIN1O00499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BIN1O00499 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIN1O00499 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIN1O00499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIN1O00499 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIN1O00499 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIN1O00499 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIN1O00499 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIN1O00499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIN1O00499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIN1O00499 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BIN1O00499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BIN1O00499 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIN1O00499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIN1O00499 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIN1O00499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIN1O00499 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIN1O00499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIN1O00499 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms