Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFRD1O00458 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFRD1O00458 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms