Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4O00268 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4O00268 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4O00268 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4O00268 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF4O00268 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF4O00268 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF4O00268 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF4O00268 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF4O00268 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF4O00268 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF4O00268 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF4O00268 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF4O00268 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF4O00268 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF4O00268 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF4O00268 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF4O00268 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF4O00268 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF4O00268 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF4O00268 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms