Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMAPO00193 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAPO00193 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAPO00193 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAPO00193 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAPO00193 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAPO00193 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAPO00193 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAPO00193 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAPO00193 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAPO00193 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAPO00193 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAPO00193 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAPO00193 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAPO00193 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAPO00193 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAPO00193 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAPO00193 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAPO00193 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAPO00193 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAPO00193 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms