Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGPSO00116 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGPSO00116 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGPSO00116 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGPSO00116 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGPSO00116 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGPSO00116 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGPSO00116 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGPSO00116 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGPSO00116 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGPSO00116 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGPSO00116 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGPSO00116 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGPSO00116 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGPSO00116 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGPSO00116 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGPSO00116 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGPSO00116 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.6 ms