Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3KT08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KT08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KT08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KT08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KT08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KT08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KT08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KT08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KT08 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KT08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KT08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KT08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KT08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KT08 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KT08 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KT08 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KT08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KT08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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