Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01387J3KSC0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms