Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
I3L3M4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
I3L3M4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
I3L3M4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
I3L3M4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
I3L3M4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
I3L3M4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
I3L3M4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
I3L3M4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
I3L3M4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
I3L3M4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
I3L3M4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
I3L3M4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
I3L3M4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
I3L3M4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
I3L3M4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms