Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF26H0Y7S4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF26H0Y7S4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms