Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB8E9PQR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms