Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM114B3SHH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM114B3SHH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms